肛肠二科是医院重点科室，担负着肛肠专业的医疗、科研、教学工作。作为省、市两级医学重点专科，科室团结奋进、开拓创新、努力拼搏、无私奉献，赢得了广大病人的赞誉。
科室现开放床位30张，医生14人，护士12人，其中高级职称5人，中级职称7人，研究生以上学历6人。拥有先进的医疗设备：电脑痔疮治疗机、射频治疗仪、微波治疗仪、铜离子电化学痔疮治疗仪等。
科主任刘博，副主任医师，外科学硕士，济南市中医肛肠病质量控制中心主任；护士长赵海燕，副主任护士，济南市“十佳护士”，在科主任和护士长带领下形成了一支“医疗技术过硬，医疗服务满意，科研学术活跃”的优秀团队，“痛苦小、术后恢复快、住院时间短”为特征的全程“无痛病房”更加成熟、完善。
科室担负着肛肠专业的医疗、科研、教学工作。开展PPH环状切除吻合术、负压吸引吊扎术、结肠镜下治疗结直肠疾病，铜离子电化学治疗等新技术新疗法，达到省内领先水平。除收治常见肛肠疾病外，在各种疑难、复杂性肛肠疾病诊断及治疗上达到了国内领先水平。
科室继承和发扬祖国医学，对“功能性便秘”、“溃疡性结肠炎”进行研究，总结出了“灌肠一号”、“灌肠二号”，应用中医药及中西医结合治疗溃疡性结肠炎取得了显著疗效。科室采用“多模式镇痛”措施，解除了病人手术后剧烈疼痛的难题，其中痔宁肠溶止痛栓的临床应用荣获济南市科技进步三等奖，痔宁膏及愈痔熏洗剂的临床研究获省、市科技进步三等奖，直肠脱出新术式、十味愈痔丸药学的临床研究均通过了省、市级鉴定，达到了国内领先水平。
科室现开展的临床诊疗项目：
1、肛肠科常见多发病及各种疑难杂症，如各种内、外痔及混合痔的综合治疗，肛周脓肿的综合治疗，各种肛瘘的治疗，直肠内、外脱垂的综合治疗，肛裂的治疗，骶尾部疾病的治疗，结直肠良性肿瘤治疗、各种顽固性便秘的综合治疗、溃疡性结直肠炎的治疗等等。
2、采用国际先进技术如TST、RPH、内痔黏膜套扎术、铜离子电化学治疗术等微创手术治疗重度混合痔，使痔治疗后康复周期缩短，并且达到全程无痛、疗效确切可靠，本科室在此领域处于领先地位。
3、在PPH技术基础上发展而来的环切加柱状纵切治疗直肠粘膜内脱垂，有效治疗老年患者因为直肠粘膜内脱垂导致的肛门坠胀不适、排便不尽感、排便排气困难、重复排便等症状。
4、内镜辅助下微创治疗大肠息肉、早癌等结直肠疾病，病人痛苦小，准确性高，创伤小，恢复快，避免开腹手术的痛苦和术后相关并发症的发生，此项技术居领先水平。